Развитие Лисичанска и других городов страны было прервано нападением на Украину немецко-фашистских захватчиков. В первые дни войны тысячи наших граждан ушли на фронт, в том числе 1200 коммунистов-добровольцев. Многие предприятия были эвакуированы в глубь страны. Осенью 1941 года фронт приблизился к городу. На этой линии части советской армии удерживали оборону более полугода.

Лисичанск дважды подвергался оккупации врага. Сотни его жителей были уничтожены фашистами. Но город не сдавался. Здесь возникла подпольная комсомольская группа. В районе Лисичанского стеклозавода и шахты "Черноморка" действовала подпольная группа, в которой участвовали Н. Непомнящий, И.Ф. Сачек, М. Русецкий, В. Чумаков и другие. Лисичане помнят и молодых патриотов Петю Добрынского, Ваню Луганского, Сережу Кострова и других не покорившихся и мстивших врагу. Все они отдали свою жизнь чтобы свободным был родной город.

Тысячи лисичан проявили мужество и героизм на фронтах Великой Отечественной войны. Бывший учитель И.Ф. Быков, ставший штурманом морской авиации, повторил подвиг Николая Гастелло. Многим за подвиги на фронтах Великой Отечественной войны было присвоено звание Героя Советского Союза.

2 сентября 1943 года части 279-й стрелковой дивизии освободили Лисичанск. Город стал возрождаться. Восстанавливались шахты, заводы. 11 января 1944 года дала ток первая турбина ГРЭС, 6 июня была восстановлена первая система Лисичанского стеклозавода, а 28 августа 1944 года поставлена на сушку стекловаренная печь завода "Пролетарий". В июне этого же года выработал первую продукцию содовый завод.

В послевоенные годы Лисичанск не только был восстановлен, но и значительно вырос, преобразился. С 1952 года он стал городом областного подчинения.